Di komisi organisasi, dalam usulan pertama tentang pemilihan Ketua Umum PBNU mendapat penolakan dari beberapa pengurus wilayah yang hadir. Dengan melakukan voting, akhirnya pemilihan ketua umum dari komisi organisasi menetapkan, pemilihan Ketua Umum PBNU dilakukan secara pemilihan langsung. Kesepakatan ini disampaikan pada sidang pleno Munas NU pada tanggal 26 September 2021.